Data Management with FHIR - Local Development build (v0.1.0) built by the FHIR (HL7® FHIR® Standard) Build Tools. See the Directory of published versions

Raw layer

Vue d'ensemble

Cette documentation décrit le schéma de base de données PostgreSQL optimisé pour le stockage des variables du socle EDSH (Entrepôt de Données de Santé en répartition), généré à partir du questionnaire FHIR Questionnaire-UsageCore.json.

Le schéma implémente une architecture relationnelle normalisée permettant de stocker l'ensemble des données de santé core définies dans le questionnaire FHIR, avec un focus sur l'interopérabilité et les performances d'interrogation.

Architecture générale

Le schéma comprend 11 tables principales organisées autour de l'entité centrale patient :

• patient : Données démographiques et identité
• patient_adresse : Informations de géolocalisation
• donnees_pmsi : Données de séjours et prises en charge (table de liaison centrale)
• diagnostics : Codes diagnostiques CIM-10
• actes : Actes médicaux et procédures CCAM
• biologie : Résultats d'examens biologiques consolidés
• prescription : Prescriptions médicamenteuses
• administration : Administrations médicamenteuses réelles
• posologie : Détails de posologie
• dossier_soins : Observations et mesures cliniques
• style_vie : Facteurs de mode de vie

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Schéma Entité/Relation

Documentation des Tables

Table patient

Description : Table consolidée des informations démographiques et d'identité patient, combinant les éléments d'identité (linkId: 2958000860428) et de géocodage (linkId: 5491974639955) du questionnaire FHIR.

Colonne	Type	Contraintes	Défaut	Description
🔑 patient_id	BIGSERIAL	PRIMARY KEY	-	Identifiant unique du patient
nom	VARCHAR(255)	-	-	Nom patient (linkId: 8605698058770)
prenom	VARCHAR(255)	-	-	Prénom patient (linkId: 6214879623503)
nir	VARCHAR(15)	CHECK format	-	Numéro inscription au Répertoire - NIR (linkId: 5711960356160)
ins	VARCHAR(50)	-	-	Identité Nationale de Santé - INS (linkId: 3764723550987)
date_naissance	DATE	CHECK validité	-	Date de naissance (linkId: 5036133558154)
sexe	VARCHAR(20)	CHECK ('h', 'f')	-	Sexe consolidé depuis PMSI (linkId: 3894630481120)
date_deces	DATE	CHECK cohérence	-	Date de décès (linkId: 5633552097315)
source_deces	VARCHAR(50)	-	-	Source de la date de décès (linkId: 9098810065693)
rang_gemellaire	INTEGER	CHECK (1-10)	-	Rang gémellaire du bénéficiaire (linkId: 6931296968515)
created_at	TIMESTAMP WITH TIME ZONE	-	CURRENT_TIMESTAMP	Horodatage de création
updated_at	TIMESTAMP WITH TIME ZONE	-	CURRENT_TIMESTAMP	Horodatage de dernière modification

Index principaux :

• idx_patient_nir : Index sur NIR (WHERE nir IS NOT NULL)
• idx_patient_ins : Index sur INS (WHERE ins IS NOT NULL)
• idx_patient_nom_prenom : Index composé nom/prénom
• idx_patient_date_naissance : Index sur date de naissance
• idx_patient_search : Index GIN pour recherche textuelle française
• idx_patient_nir_hash : Index de hachage pour recherche exacte NIR
• idx_patient_ins_hash : Index de hachage pour recherche exacte INS

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Table patient_adresse

Description : Informations de géolocalisation et adressage patient (linkId: 5491974639955).

Colonne	Type	Contraintes	Défaut	Description
🔑 patient_adresse_id	BIGSERIAL	PRIMARY KEY	-	Identifiant unique de l'adresse
🔗 patient_id	BIGINT	NOT NULL, FK	-	Référence vers patient
latitude	DECIMAL(10,7)	CHECK (-90 à 90)	-	Latitude du domicile patient (linkId: 3709843054556)
longitude	DECIMAL(10,7)	CHECK (-180 à 180)	-	Longitude du domicile patient (linkId: 7651448032665)
code_iris	VARCHAR(20)	-	-	Code IRIS du lieu de résidence
libelle_iris	VARCHAR(200)	-	-	Libellé IRIS du lieu de résidence
code_geographique_residence	VARCHAR(10)	-	-	Code géographique de résidence
libelle_geographique_residence	VARCHAR(200)	-	-	Libellé géographique de résidence
date_recueil	DATE	-	-	Date de recueil de l'information
created_at	TIMESTAMP WITH TIME ZONE	-	CURRENT_TIMESTAMP	Horodatage de création
updated_at	TIMESTAMP WITH TIME ZONE	-	CURRENT_TIMESTAMP	Horodatage de dernière modification

Index spécialisés :

• idx_patient_coords_gist : Index spatial GIST pour les coordonnées géographiques
• idx_patient_adresse_iris : Index sur code IRIS
• idx_patient_adresse_date : Index composé patient/date de recueil

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Table donnees_pmsi

Description : Table centrale des données de séjour PMSI (Programme de médicalisation des systèmes d'information) - point de liaison pour toutes les données cliniques (linkId: 2825244231605).

Colonne	Type	Contraintes	Défaut	Description
🔑 pmsi_id	BIGSERIAL	PRIMARY KEY	-	Identifiant unique du séjour PMSI
🔗 patient_id	BIGINT	NOT NULL, FK	-	Référence vers patient
mode_sortie	VARCHAR(100)	-	-	Mode de sortie du séjour
age_admission	INTEGER	CHECK (0-150)	-	Âge à l'admission (nécessaire si pas de date de naissance)
date_debut_sejour	DATE	-	-	Date de début du séjour
date_fin_sejour	DATE	CHECK cohérence dates	-	Date de fin du séjour
mode_entree	VARCHAR(100)	-	-	Mode d'entrée dans l'établissement
etablissement	VARCHAR(255)	-	-	Établissement de soins
service	VARCHAR(255)	-	-	Service médical
unite_fonctionnelle	VARCHAR(255)	-	-	Unité fonctionnelle
created_at	TIMESTAMP WITH TIME ZONE	-	CURRENT_TIMESTAMP	Horodatage de création
updated_at	TIMESTAMP WITH TIME ZONE	-	CURRENT_TIMESTAMP	Horodatage de dernière modification

Index de performance :

• idx_pmsi_patient_id : Index sur patient_id
• idx_pmsi_date_debut : Index sur date de début de séjour
• idx_pmsi_date_fin : Index sur date de fin de séjour
• idx_pmsi_etablissement : Index sur établissement
• idx_pmsi_patient_date : Index composé patient/date de début
• idx_pmsi_covering : Index couvrant avec INCLUDE
• idx_pmsi_duree_sejour : Index calculé sur la durée de séjour

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Table diagnostics

Description : Codes diagnostiques et informations liées aux séjours utilisant les classifications CIM-10 (linkId: 9391816419630).

Colonne	Type	Contraintes	Défaut	Description
🔑 diagnostic_id	BIGSERIAL	PRIMARY KEY	-	Identifiant unique du diagnostic
🔗 patient_id	BIGINT	NOT NULL, FK	-	Référence vers patient
🔗 pmsi_id	BIGINT	NOT NULL, FK	-	Référence vers séjour PMSI
code_diagnostic	VARCHAR(20)	NOT NULL, CHECK longueur	-	Code diagnostic CIM-10
type_diagnostic	VARCHAR(50)	-	-	Type de diagnostic (principal, associé, etc.)
libelle_diagnostic	TEXT	-	-	Libellé descriptif du diagnostic
date_recueil	DATE	CHECK ≤ CURRENT_DATE	-	Date de recueil de l'information
created_at	TIMESTAMP WITH TIME ZONE	-	CURRENT_TIMESTAMP	Horodatage de création
updated_at	TIMESTAMP WITH TIME ZONE	-	CURRENT_TIMESTAMP	Horodatage de dernière modification

Index de recherche :

• idx_diagnostics_pmsi_id : Index sur pmsi_id
• idx_diagnostics_code : Index sur code diagnostic
• idx_diagnostics_type : Index sur type de diagnostic
• idx_diagnostics_pmsi_code : Index composé pmsi/code
• idx_diagnostics_patient_code : Index composé patient/code/date

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Table actes

Description : Actes médicaux et procédures réalisés durant les séjours utilisant les classifications CCAM et autres standards (linkId: 591926901726).

Colonne	Type	Contraintes	Défaut	Description
🔑 acte_id	BIGSERIAL	PRIMARY KEY	-	Identifiant unique de l'acte
🔗 patient_id	BIGINT	NOT NULL, FK	-	Référence vers patient
🔗 pmsi_id	BIGINT	NOT NULL, FK	-	Référence vers séjour PMSI
code_acte	VARCHAR(20)	NOT NULL, CHECK longueur	-	Code de l'acte médical (CCAM, etc.)
libelle_acte	TEXT	-	-	Libellé descriptif de l'acte
date_acte	TIMESTAMP	CHECK ≤ CURRENT_TIMESTAMP	-	Date et heure de réalisation de l'acte
executant	VARCHAR(255)	-	-	Professionnel exécutant (non prévu dans le socle)
date_recueil	DATE	CHECK ≤ CURRENT_DATE	-	Date de recueil de l'information
created_at	TIMESTAMP WITH TIME ZONE	-	CURRENT_TIMESTAMP	Horodatage de création
updated_at	TIMESTAMP WITH TIME ZONE	-	CURRENT_TIMESTAMP	Horodatage de dernière modification

Index optimisés :

• idx_actes_pmsi_id : Index sur pmsi_id
• idx_actes_code : Index sur code d'acte
• idx_actes_date : Index sur date d'acte
• idx_actes_date_recueil : Index sur date de recueil
• idx_actes_pmsi_code : Index composé pmsi/code
• idx_actes_patient_code : Index composé patient/code/date

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Table biologie

Description : Table consolidée des résultats d'examens biologiques, différenciés par codes LOINC et types d'examens incluant fonction rénale, bilan hépatique, hémogramme et autres tests (linkId: 7702944131447).

Colonne	Type	Contraintes	Défaut	Description
🔑 biologie_id	BIGSERIAL	PRIMARY KEY	-	Identifiant unique du résultat biologique
🔗 patient_id	BIGINT	NOT NULL, FK	-	Référence vers patient
code_loinc	VARCHAR(20)	-	-	Code LOINC identifiant le test biologique
libelle_test	VARCHAR(255)	-	-	Libellé descriptif du test
type_examen	VARCHAR(100)	CHECK types valides	-	Type examen: fonction_renale, bilan_hepatique, hemogramme, autres
valeur	DECIMAL(15,6)	CHECK ≥ 0	-	Valeur numérique du résultat
unite	VARCHAR(50)	-	-	Unité de mesure
valeur_texte	TEXT	-	-	Valeur textuelle du résultat
date_prelevement	TIMESTAMP WITH TIME ZONE	CHECK ≤ CURRENT_TIMESTAMP	-	Date et heure du prélèvement
statut_validation	VARCHAR(50)	CHECK valeurs valides	-	Statut de validation (en_attente, valide, rejete, en_cours)
borne_inf_normale	DECIMAL(15,6)	CHECK cohérence bornes	-	Borne inférieure de normalité
borne_sup_normale	DECIMAL(15,6)	CHECK cohérence bornes	-	Borne supérieure de normalité
laboratoire	VARCHAR(255)	-	-	Laboratoire d'analyse (non prévu dans le socle)
created_at	TIMESTAMP WITH TIME ZONE	-	CURRENT_TIMESTAMP	Horodatage de création
updated_at	TIMESTAMP WITH TIME ZONE	-	CURRENT_TIMESTAMP	Horodatage de dernière modification

Index spécialisés pour biologie :

• idx_biologie_patient_id : Index sur patient_id
• idx_biologie_code_loinc : Index sur code LOINC
• idx_biologie_type_examen : Index sur type d'examen
• idx_biologie_date_prelevement : Index sur date de prélèvement
• idx_biologie_statut_validation : Index sur statut de validation
• idx_biologie_patient_loinc : Index composé patient/LOINC
• idx_biologie_patient_type : Index composé patient/type
• idx_biologie_covering : Index couvrant avec INCLUDE
• idx_biologie_loinc_hash : Index de hachage pour recherche exacte LOINC
• idx_biologie_valeur_non_null : Index partiel sur valeurs non nulles
• idx_biologie_date_patient : Index optimisé date/patient

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Table prescription

Description : Données de prescription médicamenteuse avec codage ATC pour la pharmacovigilance et la recherche clinique (linkId: 817801935685).

Colonne	Type	Contraintes	Défaut	Description
🔑 prescription_id	BIGSERIAL	PRIMARY KEY	-	Identifiant unique de la prescription
🔗 patient_id	BIGINT	NOT NULL, FK	-	Référence vers patient
prescripteur	VARCHAR(50)	-	-	Professionnel prescripteur
denomination	VARCHAR(255)	-	-	Dénomination du médicament
code_atc	VARCHAR(20)	-	-	Code ATC du médicament
voie_administration	VARCHAR(100)	-	-	Voie d'administration prévue
date_prescription	DATE	-	-	Date de la prescription (non prévu dans le socle)
date_debut_prescription	DATE	CHECK cohérence dates	-	Date de début de la prescription
date_fin_prescription	DATE	CHECK cohérence dates	-	Date de fin de la prescription
created_at	TIMESTAMP WITH TIME ZONE	-	CURRENT_TIMESTAMP	Horodatage de création
updated_at	TIMESTAMP WITH TIME ZONE	-	CURRENT_TIMESTAMP	Horodatage de dernière modification

Index de prescription :

• idx_prescription_patient_id : Index sur patient_id
• idx_prescription_code_atc : Index sur code ATC
• idx_prescription_date_prescription : Index sur date de prescription
• idx_prescription_patient_atc : Index composé patient/ATC
• idx_prescription_covering : Index couvrant avec INCLUDE
• idx_prescription_atc_hash : Index de hachage pour recherche exacte ATC
• idx_prescription_active : Index partiel sur prescriptions actives
• idx_prescription_period : Index sur période de prescription

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Table posologie

Description : Informations détaillées de posologie pour les médicaments (linkId: 6348237104421).

Colonne	Type	Contraintes	Défaut	Description
🔑 posologie_id	BIGSERIAL	PRIMARY KEY	-	Identifiant unique de la posologie
🔗 prescription_id	BIGINT	NOT NULL, FK	-	Référence vers prescription
nombre_prises_par_jour	INTEGER	CHECK (1-24)	-	Nombre de prises par jour
quantite	DECIMAL(10,3)	CHECK > 0	-	Quantité par prise
unite_quantite	VARCHAR(20)	-	-	Unité de la quantité
date_heure_debut	TIMESTAMP	CHECK cohérence dates	-	Date et heure de début
date_heure_fin	TIMESTAMP	CHECK cohérence dates	-	Date et heure de fin
created_at	TIMESTAMP WITH TIME ZONE	-	CURRENT_TIMESTAMP	Horodatage de création
updated_at	TIMESTAMP WITH TIME ZONE	-	CURRENT_TIMESTAMP	Horodatage de dernière modification

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Table administration

Description : Données d'exposition médicamenteuse avec codage ATC pour la pharmacovigilance et la recherche clinique, traçant les administrations réelles (linkId: 817801935685).

Colonne	Type	Contraintes	Défaut	Description
🔑 administration_id	BIGSERIAL	PRIMARY KEY	-	Identifiant unique de l'administration
🔗 patient_id	BIGINT	NOT NULL, FK	-	Référence vers patient
🔗 prescription_id	BIGINT	FK	-	Référence vers prescription (optionnelle)
denomination	VARCHAR(255)	-	-	Dénomination du médicament administré
code_atc	VARCHAR(20)	-	-	Code ATC du médicament
voie_administration	VARCHAR(100)	-	-	Voie d'administration réelle
quantite	DECIMAL(10,3)	CHECK > 0	-	Quantité administrée
unite_quantite	VARCHAR(20)	-	-	Unité de la quantité
date_heure_debut	TIMESTAMP	CHECK cohérence dates	-	Date et heure de début d'administration
date_heure_fin	TIMESTAMP	CHECK cohérence dates	-	Date et heure de fin d'administration
created_at	TIMESTAMP WITH TIME ZONE	-	CURRENT_TIMESTAMP	Horodatage de création
updated_at	TIMESTAMP WITH TIME ZONE	-	CURRENT_TIMESTAMP	Horodatage de dernière modification

Index d'administration :

• idx_administration_patient_id : Index sur patient_id
• idx_administration_code_atc : Index sur code ATC
• idx_administration_denomination : Index sur dénomination
• idx_administration_date_heure_debut : Index sur date de début
• idx_administration_atc_hash : Index de hachage pour recherche exacte ATC
• idx_administration_timeline : Index chronologique optimisé

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Table dossier_soins

Description : Mesures et observations cliniques incluant signes vitaux, mesures physiques et données de soins infirmiers (linkId: 305831246173).

Colonne	Type	Contraintes	Défaut	Description
🔑 soin_id	BIGSERIAL	PRIMARY KEY	-	Identifiant unique de l'observation
🔗 patient_id	BIGINT	NOT NULL, FK	-	Référence vers patient
code_loinc	VARCHAR(20)	-	-	Code LOINC de l'observation
libelle_test	VARCHAR(255)	-	-	Libellé de l'observation
valeur	DECIMAL(15,6)	CHECK ≥ 0	-	Valeur numérique mesurée
unite	VARCHAR(50)	-	-	Unité de mesure
valeur_code	VARCHAR(50)	-	-	Valeur codée
valeur_texte	TEXT	-	-	Valeur textuelle
date_mesure	DATE	CHECK ≤ CURRENT_DATE	-	Date de la mesure
unite_soins	VARCHAR(255)	-	-	Unité de soins (non prévu dans le socle)
professionnel	VARCHAR(255)	-	-	Professionnel réalisant la mesure (non prévu dans le socle)
created_at	TIMESTAMP WITH TIME ZONE	-	CURRENT_TIMESTAMP	Horodatage de création
updated_at	TIMESTAMP WITH TIME ZONE	-	CURRENT_TIMESTAMP	Horodatage de dernière modification

Index de soins :

• idx_soins_patient_id : Index sur patient_id
• idx_soins_loinc : Index sur code LOINC
• idx_soins_date_mesure : Index sur date de mesure
• idx_dossier_soins_timeline : Index chronologique optimisé

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Table style_vie

Description : Informations consolidées sur le mode de vie incluant tabac, alcool, drogues et activité physique (linkId: 1693164086678).

Colonne	Type	Contraintes	Défaut	Description
🔑 style_vie_id	BIGSERIAL	PRIMARY KEY	-	Identifiant unique du style de vie
🔗 patient_id	BIGINT	NOT NULL, FK	-	Référence vers patient
consommation_tabac	VARCHAR(100)	-	-	Information sur la consommation de tabac
consommation_alcool	VARCHAR(100)	-	-	Information sur la consommation d'alcool
consommation_autres_drogues	VARCHAR(100)	-	-	Information sur la consommation d'autres drogues
activite_physique	VARCHAR(100)	-	-	Information sur l'activité physique
date_recueil	DATE	CHECK ≤ CURRENT_DATE	-	Date de recueil de l'information
created_at	TIMESTAMP WITH TIME ZONE	-	CURRENT_TIMESTAMP	Horodatage de création
updated_at	TIMESTAMP WITH TIME ZONE	-	CURRENT_TIMESTAMP	Horodatage de dernière modification

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Matrice des Relations

Table Source	Colonne	Table Référencée	Colonne Référencée	Type de Relation	Action DELETE
patient_adresse	patient_id	patient	patient_id	1:N	CASCADE
donnees_pmsi	patient_id	patient	patient_id	1:N	CASCADE
diagnostics	patient_id	patient	patient_id	1:N	CASCADE
diagnostics	pmsi_id	donnees_pmsi	pmsi_id	1:N	CASCADE
actes	patient_id	patient	patient_id	1:N	CASCADE
actes	pmsi_id	donnees_pmsi	pmsi_id	1:N	CASCADE
biologie	patient_id	patient	patient_id	1:N	CASCADE
prescription	patient_id	patient	patient_id	1:N	CASCADE
posologie	prescription_id	prescription	prescription_id	1:N	CASCADE
administration	patient_id	patient	patient_id	1:N	CASCADE
administration	prescription_id	prescription	prescription_id	1:N	RESTRICT
dossier_soins	patient_id	patient	patient_id	1:N	CASCADE
style_vie	patient_id	patient	patient_id	1:N	CASCADE

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Règles Métier et Contraintes CHECK

Contraintes sur la table patient

• chk_patient_sexe : Le sexe doit être 'h' (homme) ou 'f' (femme)
• chk_patient_date_naissance : Date de naissance entre 1900-01-01 et la date courante
• chk_patient_date_deces : Date de décès postérieure à la date de naissance et ≤ date courante
• chk_patient_nir_format : Format NIR : 13 à 15 chiffres
• chk_patient_rang_gemellaire : Rang gémellaire entre 1 et 10

Contraintes sur la table patient_adresse

• chk_patient_latitude : Latitude entre -90 et 90 degrés
• chk_patient_longitude : Longitude entre -180 et 180 degrés

Contraintes sur la table donnees_pmsi

• chk_pmsi_dates : Date de fin de séjour ≥ date de début de séjour
• chk_pmsi_age_admission : Âge à l'admission entre 0 et 150 ans

Contraintes sur la table biologie

• chk_biologie_bornes : Borne supérieure ≥ borne inférieure
• chk_biologie_type_examen : Type d'examen parmi 'fonction_renale', 'bilan_hepatique', 'hemogramme', 'autres'
• chk_biologie_valeur_positive : Valeur ≥ 0
• chk_biologie_date_prelevement : Date de prélèvement ≤ timestamp actuel
• chk_biologie_statut_validation : Statut parmi 'en_attente', 'valide', 'rejete', 'en_cours'

Contraintes sur les médicaments (prescription, administration, posologie)

• chk_prescription_dates : Date de fin ≥ date de début de prescription
• chk_administration_dates : Date/heure de fin ≥ date/heure de début
• chk_administration_quantite : Quantité > 0
• chk_posologie_prises_jour : Nombre de prises par jour entre 1 et 24
• chk_posologie_quantite : Quantité > 0
• chk_posologie_dates : Date/heure de fin ≥ date/heure de début

Contraintes sur les soins et lifestyle

• chk_soins_valeur_positive : Valeur mesurée ≥ 0
• chk_soins_date_mesure : Date de mesure ≤ date courante
• chk_style_vie_date_recueil : Date de recueil ≤ date courante

Contraintes sur les données cliniques

• chk_diagnostics_code_format : Code diagnostic entre 3 et 20 caractères
• chk_diagnostics_date_recueil : Date de recueil ≤ date courante
• chk_actes_code_format : Code acte entre 4 et 20 caractères
• chk_actes_date_acte : Date d'acte ≤ timestamp actuel
• chk_actes_date_recueil : Date de recueil ≤ date courante

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Documentation générée automatiquement à partir du script DDL PostgreSQL pour les variables du socle EDSH