Adicap

import edsnlp, edsnlp.pipes as eds

nlp = edsnlp.blank("eds")
nlp.add_pipe(eds.sentences())
nlp.add_pipe(eds.adicap())

text = """
COMPTE RENDU D’EXAMEN

Antériorité(s) :  NEANT


Renseignements cliniques :
Contexte d'exploration d'un carcinome canalaire infiltrant du quadrant supéro-
externe du sein droit. La lésion biopsiée ce jour est située à 5,5 cm de la lésion
du quadrant supéro-externe, à l'union des quadrants inférieurs.


Macrobiopsie 10G sur une zone de prise de contraste focale à l'union des quadrants
inférieurs du sein droit, mesurant 4 mm, classée ACR4

14 fragments ont été communiqués fixés en formol (lame n° 1a et lame n° 1b) . Il
n'y a pas eu d'échantillon congelé. Ces fragments ont été inclus en paraffine en
totalité et coupés sur plusieurs niveaux.
Histologiquement, il s'agit d'un parenchyme mammaire fibroadipeux parfois
légèrement dystrophique avec quelques petits kystes. Il n'y a pas d'hyperplasie
épithéliale, pas d'atypie, pas de prolifération tumorale. On note quelques
suffusions hémorragiques focales.

Conclusion :
Légers remaniements dystrophiques à l'union des quadrants inférieurs du sein droit.
Absence d'atypies ou de prolifération tumorale.

Codification :   BHGS0040
"""

doc = nlp(text)

doc.ents
# Out: (BHGS0040,)

ent = doc.ents[0]

ent.label_
# Out: adicap

ent._.adicap.dict()
# Out: {'code': 'BHGS0040',
# 'sampling_mode': 'BIOPSIE CHIRURGICALE',
# 'technic': 'HISTOLOGIE ET CYTOLOGIE PAR INCLUSION',
# 'organ': "SEIN (ÉGALEMENT UTILISÉ CHEZ L'HOMME)",
# 'pathology': 'PATHOLOGIE GÉNÉRALE NON TUMORALE',
# 'pathology_type': 'ETAT SUBNORMAL - LESION MINEURE',
# 'behaviour_type': 'CARACTERES GENERAUX'}